Кафедра компьютерных сетей возникла в 1986 году одновременно с созданием факультета информатики и вычислительной техники (ИВТ) ЯрГУ, но до 2001 года называлась кафедрой систем обработки данных (СОД). В этих рамках кафедра готовила специалистов в области вычислительных машин комплексов и сетей. Кафедра непосредственно участвовала в исследованиях по разработке системного программного обеспечения по проекту создания отечественных супер-ЭВМ, а первым ее заведующим был профессор Курчидис В.А. С 2001 года кафедрой стал руководить профессор, доктор физико-математических наук Майоров В.В. и кафедра была переименована в кафедру Компьютерных сетей. С 2009 кафедрой руководит доктор физико-математических наук, профессор Глызин С.Д.

Научная работа, выполняемая на кафедре, посвящена в основном изучению динамических свойств моделей нейронных сетей, описываемых системами уравнений с запаздыванием.

На базе кафедры созданы и функционирует два научных семинара один из которых направлен на изучение нейронных сетей и ассоциаций, а второй совместный с кафедрой математического моделирования математического факультета, посвящен различным вопросам нелинейной динамики и синергетики.

Сотрудники кафедры принимают активное участие в выпуске научного журнала «Моделирование и анализ информационных систем». Профессор Глызин С.Д. выполняет обязанности зам.главного редактора этого журнала, а доцент Толбей А.О. входит в состав технической редакции.

Примерно половина выпускников, обучающихся по направлению «Прикладная математика и информатика» проходят специализацию по этой кафедре.